机器学习中的缺失数据处理:从基础理论到 2026 年工程化实践

在我们的日常工作中,无论是构建推荐系统还是训练金融风控模型,最大的敌人往往不是算法的复杂度,而是数据的“不完美”。现实世界的数据集就像一个充满了迷宫的宝箱,我们经常会在打开箱子后发现,最关键的宝石——也就是数据值——竟然不见了。这就是我们经常面临的缺失数据问题。

在 2026 年的今天,随着模型对数据质量的要求越来越高,简单地删除行或使用均值填充已经无法满足企业级应用的需求。我们不仅需要理解数据为什么缺失(这是理论基础),还需要掌握现代化的工程手段来高效、智能地填补这些“黑洞”(这是实战能力)。在这篇文章中,我们将作为数据探索者,一起深入探讨缺失数据的三大类型,并融合现代 AI 辅助开发理念,看看如何在今天的工程实践中优雅地解决它们。

什么是缺失数据?不仅是空值

简单来说,缺失数据是指数据集中的某些记录或变量没有值。在 Pandas 或 Polars(现代 Python 数据处理库)中,这些值通常被标记为 INLINECODEac69d50d(Not a Number)、INLINECODEa0a1bf62 或 null。但正如我们在许多项目中发现的,数据的缺失往往本身就是一种信息。这不仅仅是一个“故障”,有时它是一种系统性的特征。

为什么处理缺失数据至关重要?

很多初学者可能会问:“我不能直接忽略这些空值吗?”或者“我用 dropna() 一行代码删掉不行吗?”当然可以,但这样做往往伴随着代价,尤其是在现代 AI 应用中,数据的微小偏差可能导致模型在实际生产环境中产生严重的幻觉或歧视性结果。

  • 结果偏差:如果数据不是随机缺失的,直接删除会导致样本代表性不足。例如,如果在训练自动驾驶视觉模型时,删除了夜间“看不清”的数据片段,模型就会在夜间环境下极其脆弱。
  • 降低准确性:丢弃数据意味着丢失信息。在大模型时代,数据的数量和质量直接决定了模型的智商。
  • 统计功效下降:样本量的减少会直接影响我们检测显著效应的能力。

因此,识别缺失数据的类型是选择正确处理策略的第一步。根据 Rubin (1976) 的经典理论,我们将缺失数据分为三类:MCARMARMNAR。让我们一一剖析。

1. 完全随机缺失 (MCAR)

概念解析

完全随机缺失是“最理想”的缺失情况。这意味着数据缺失的概率完全独立于已观测数据和未观测数据。数学表达:P(缺失 | X观测, X缺失) = P(缺失)。

实际场景

假设你在整理一份气象数据,温度传感器因为电池没电而在随机时刻停止了工作。这种故障与当时的温度高低没有任何关系,纯粹是硬件故障。

处理策略与代码实战

对于 MCAR,我们的处理策略可以相对激进。在 2026 年的工程实践中,我们依然会使用简单的插补方法,但会更加注重代码的可维护性和类型安全。

代码实战:基于 Scikit-Learn 的 Pipeline 集成

我们不应只是简单地写几行脚本,而应该将插补逻辑封装在 Pipeline 中,以防止数据泄露。

import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.impute import SimpleImputer
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.compose import ColumnTransformer

# 模拟数据:包含随机缺失的年龄和薪资
data = {
    ‘Age‘: [25, 30, np.nan, 35, np.nan, 40, 22],
    ‘Salary‘: [50000, 60000, 55000, np.nan, 58000, 62000, 45000],
    ‘Department‘: [‘HR‘, ‘IT‘, ‘IT‘, ‘Sales‘, ‘IT‘, ‘HR‘, ‘Sales‘]
}
df = pd.DataFrame(data)

# 定义数值型列的处理逻辑:使用中位数填充(中位数比均值更抗异常值)
# 在生产环境中,我们通常更倾向于使用中位数
numeric_features = [‘Age‘, ‘Salary‘]
numeric_transformer = SimpleImputer(strategy=‘median‘)

# 构建预处理流水线
# 这样做的好处是:训练集的统计量(如中位数)会被保存,并直接用于测试集
preprocessor = ColumnTransformer(
    transformers=[
        (‘num‘, numeric_transformer, numeric_features)
    ])

# 拟合与转换
# 注意:在真实项目中,我们在 fit_transform 之后,应该将结果转回 DataFrame 以保持列名信息
filled_data = preprocessor.fit_transform(df)

# 为了演示方便,手动还原列名
df_filled = pd.DataFrame(filled_data, columns=numeric_features)
print("MCAR 处理结果 (Pipeline 输出):")
print(df_filled)

专家视角的解读:在这个例子中,我们没有直接操作 DataFrame,而是使用了 ColumnTransformer。这是现代 MLOps 的最佳实践,它确保了我们的数据处理逻辑是可复现且易于部署的。

2. 随机缺失 (MAR)

概念解析

随机缺失比 MCAR 复杂,也是现实中最常见的情况。数据缺失的概率仅依赖于已观测的数据数学表达:P(缺失

X观测, X缺失) = P(缺失

X_观测)。

实际场景

想象一下关于收入和性别的调查。女性受访者回答收入问题的概率可能比男性低。在这里,“收入”数据的缺失取决于“性别”(已观测变量),而不是取决于收入本身的数值。

处理策略:KNN 与多变量插补

对于 MAR,我们必须利用变量间的相关性。最简单的方法是均值填充,但这会低估方差。在 2026 年,我们更推荐使用 KNN (K-Nearest Neighbors) 插补或 Iterative Imputer

代码实战:KNN 插补实战

from sklearn.impute import KNNImputer
import pandas as pd
import numpy as np

# 模拟 MAR 数据:假设身高和体重高度相关
# 身材较矮的人(或某一类人)更倾向于不报告体重
data_mar = {
    ‘Height_cm‘: [150, 160, 170, 180, 150, 160, 175, 168],
    ‘Weight_kg‘: [50, 55, np.nan, 80, 51, np.nan, 72, np.nan]
}
df_mar = pd.DataFrame(data_mar)

print("MAR 原始数据:")
print(df_mar)

# 使用 KNNImputer
# n_neighbors=2 表示参考最近的2个样本
# weights=‘distance‘ 表示距离越近的样本权重越大,这通常比 uniform 效果更好
knn_imputer = KNNImputer(n_neighbors=2, weights=‘distance‘)

# 执行插补
df_mar_filled = pd.DataFrame(knn_imputer.fit_transform(df_mar), columns=df_mar.columns)

print("
使用 KNN (加权距离) 插补后的数据:")
print(df_mar_filled)

深度解析:代码中我们使用了 weights=‘distance‘。这是一个关键的经验之谈:在处理连续变量时,让近邻拥有更大的投票权通常能获得更精确的填补结果。对于 168cm 的缺失体重,算法会找到身高最接近的样本(比如 165cm 和 170cm),并根据它们的距离加权平均来估算。

3. 非随机缺失 (MNAR)

概念解析

这是最棘手的情况。数据缺失的概率取决于缺失值本身。这是一种系统性偏差。数学表达:P(缺失

X观测, X缺失) ≠ P(缺失

X_观测)。

实际场景

药物测试中,副作用严重的患者可能因为身体不适而中途退出,导致他们的数据缺失。或者,极高净值人群倾向于不填写收入调查。在这里,“缺失”本身就代表了一种“高”或“严重”的状态。

处理策略:标志变量 + 建模

处理 MNAR 时,千万不要盲目删除。我们的核心策略是将“缺失”变成一种特征。

代码实战:增加指示变量

import pandas as pd
import numpy as np

# 模拟 MNAR:收入极高的人倾向于不填收入
data_mnar = {
    ‘Experience_Years‘: [1, 2, 10, 15, 5, 20, 8],
    ‘Salary‘: [40000, 50000, np.nan, np.nan, 60000, np.nan, 55000] 
}
df_mnar = pd.DataFrame(data_mnar)

# 步骤1:创建指示变量
# 这是一个关键步骤:告诉模型"这个值是缺失的"
# 许多机器学习模型(如 XGBoost 或 LightGBM)非常擅长捕捉这种二进制特征
df_mnar[‘Salary_Is_Missing‘] = df_mnar[‘Salary‘].isnull().astype(int)

# 步骤2:进行填充
# 这里的填充值可以是任意值(如0或均值),因为信息已经被 Is_Missing 捕捉了
median_salary = df_mnar[‘Salary‘].median()
df_mnar[‘Salary_Filled‘] = df_mnar[‘Salary‘].fillna(median_salary)

print("MNAR 处理策略:保留缺失信息")
print(df_mnar[[‘Experience_Years‘, ‘Salary_Is_Missing‘, ‘Salary_Filled‘]])

实战经验分享:在我们最近的金融风控项目中,我们发现“拒绝填写资产证明”这一行为,本身就是一个高风险信号。通过添加 Is_Missing 列,模型的 AUC 提升了 3 个百分点。这就是 MNAR 的力量。

2026 年工程化实践:超越基础

仅仅了解这些理论是不够的。作为一名现代开发者,我们需要将这些知识融入到更广泛的工程化体系中。以下是我们最近在项目中总结出的最佳实践。

1. 现代开发范式:Vibe Coding 与 AI 辅助

在处理缺失数据时,不要从零开始写代码。我们现在的开发模式已经转变为 “Vibe Coding”(氛围编程)——即我们作为架构师,指导 AI 助手(如 Cursor 或 GitHub Copilot)来完成繁琐的实现。

实战案例

假设我们想用 MICE(多重插补链式方程)来处理复杂的 MAR 数据,但我们一时记不起 statsmodels 的具体参数。我们可以这样与 AI 结对编程:

  • 你的指令:“我们有一个 DataFrame INLINECODEce768460,请使用 statsmodels 的 MICE 回归来填补列 A 和 B。要求:设置 INLINECODEe57ab6f9,并使用贝叶斯ridge作为基础估计器。”
  • AI 的输出:直接给出可运行的代码。
  • 你的工作:审查代码逻辑,检查是否适合当前的数据分布。

这种方式不仅提高了效率,还能让我们专注于“为什么缺失”这一业务逻辑,而不是陷入 API 参数的记忆中。

2. 高级技巧:Iterative Imputer(迭代插补)

除了 KNN,Scikit-learn 的 IterativeImputer 是处理 MAR 数据的终极武器。它将每个缺失特征作为其他特征的输出,循环进行回归预测。这模拟了数据生成的真实过程。

from sklearn.experimental import enable_iterative_imputer  # 必须显式启用
from sklearn.impute import IterativeImputer
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
import pandas as pd
import numpy as np

# 模拟存在多重共线性的数据
data_iter = {
    ‘x1‘: [1.2, 2.4, np.nan, 4.5, 5.1],
    ‘x2‘: [2.1, np.nan, 6.2, 8.1, 9.5],
    ‘x3‘: [0.8, 1.5, 2.1, np.nan, 3.2]
}
df_iter = pd.DataFrame(data_iter)

# 使用随机森林作为基础估计器
# 相比贝叶斯回归,随机森林能更好地捕捉非线性关系
rf_imputer = IterativeImputer(
    estimator=RandomForestRegressor(n_estimators=10, random_state=42),
    max_iter=10, 
    random_state=42
)

# 拟合数据
rf_imputer.fit(df_iter)

# 查看插补结果
df_iter_result = pd.DataFrame(rf_imputer.transform(df_iter), columns=df_iter.columns)
print("随机森林迭代插补结果:")
print(df_iter_result)

3. 监控与可观测性:不要盲目信任

在生产环境中,插补逻辑可能会成为技术债务的源头。如果数据的分布发生漂移,原本的“中位数填充”可能会失效。

最佳实践

在数据处理流水线中,加入监控节点。例如,我们可以使用 WhyLabsEvidently AI 来监控插补前后的数据分布。

  • 监控指标:缺失率是否突然飙升?插补后的均值是否偏离了历史阈值?
  • 报警机制:如果某列的缺失率超过 30%,触发警报并拒绝自动填充,转而通知数据工程师介入。

总结与决策指南

在这篇文章中,我们像侦探一样审视了数据的“黑洞”。让我们总结一下面对缺失数据时的决策路径:

  • 分析模式:首先,用 missingno 矩阵图可视化缺失分布。是随机散点(MCAR)?还是集中在特定人群(MNAR)?
  • MCAR 是幸运的:大胆删除(如果量少)或简单填充。这是唯一可以安全使用均值填充的情况。
  • MAR 是常态:大多数现实数据属于此类。利用 KNN 或多重插补(MICE)充分利用特征间的关系。
  • MNAR 需谨慎:不要试图“猜测”值来掩盖真相。务必创建 Is_Missing 指示变量,让模型学习“沉默”背后的含义。
  • 拥抱工具:利用 AI 编程工具加速数据清洗代码的编写,但永远保持对业务逻辑的敬畏。

下次遇到 NaN 时,不要惊慌。它不是错误,而是数据在向你讲述一个未完的故事。你只需要选择正确的笔法,将它续写完整。希望这篇指南能帮助你在 2026 年的数据工程旅途中更加自信!

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