如何在R语言的caret包中使用Box-Cox变换

在这篇文章中,我们将一起探索如何在 R编程语言 中利用 caret 包来应用 Box-Cox 变换。

R语言中的Box-Cox变换

R语言中的 Box-Cox 变换是一种通过应用幂变换将非正态数据转换为正态分布的技术。这项技术在统计建模中通常用于改善数据的正态性并稳定方差。R 语言中的 caret 包为我们提供了一种便捷的方式,可以对数据集中的预测变量应用 Box-Cox 变换。

以下方程定义了 R 语言中的 Box-Cox 变换:

y(lambda) = (y^lambda - 1) / lambda, if lambda != 0
log(y), if lambda = 0
λ

变换

-2

1/x^2

-1

1/x

-0.5

1/sqrt(x)

0

log(x)

0.5

sqrt(x)

1

x

2

x^2其中 y 是原始变量,lambda 是变换参数,y(lambda) 是变换后的变量。

R语言中的box cox函数

我们将使用 MASS 包来找出 R 语言中的 Box-Cox 变换。

R


CODEBLOCK_6d5fcd70

输出:

!ghR语言中的Box Cox变换

我们创建了两个向量,然后应用 Box-Cox 方法来寻找 R 语言中进行 Box-Cox 变换的最佳 lambda 值。

使用Box-Cox变换响应变量

R


CODEBLOCK_03b85d56

输出:

原始数据:
    y  x
1  10 70
2  10 75
3  20 80
4  25 35
5  28 25
6  30 40
7  35 45
8  38 60
9  60 65
10 70 70
11 80 55

Box-Cox变换的最佳lambda值: 0.1414141 

变换后的数据:

   y_transformed  x
1       2.721696 70
2       2.721696 75
3       3.730249 80
4       4.076538 35
5       4.256637 25
6       4.367701 40
7       4.619802 45
8       4.756560 60
9       5.545769 65
10      5.823832 70
11      6.069650 55

现在,我们将学习如何在 R 语言中使用 caret 包来执行 Box-Cox 变换。

Caret 包

R 语言中的 caret 包(Classification And Regression Training 的缩写)是一个功能强大的工具包,用于构建和评估预测模型。它为各种机器学习算法和数据预处理技术提供了统一的接口,使我们能够以一致且可复现的方式轻松尝试不同的模型和技术。

在R中使用Box-Cox变换的步骤

步骤 1: 加载包

首先,我们需要加载必要的包,即用于应用 Box-Cox 变换的 caret 包,以及用于数据图形展示的 ggplot2 包

library(caret)
library(ggplot2)

步骤 2: 加载数据集

然后加载数据集。我们可以使用 R 的内置数据集,也可以创建自己的数据集。我们可以使用各种函数,如 rlnorm()rgamma() 来定义我们的数据集。

data <- rgamma(...)

步骤 3: 应用Box Cox变换

使用 BoxCoxTrans() 函数应用 Box-Cox 变换,并将数据集作为参数传递。

bc_trans <- BoxCoxTrans(data)

步骤 4: 预测值

transformed_data <- predict(bc_trans, data)

步骤 5: 绘制模型

最后一步是绘制变换后的直方图。

ggplot(data.frame(x = transformed_data), aes(x)) +
  geom_histogram(binwidth = 0.8, color = "black", fill = "lightblue") +
  ggtitle("Box-Cox变换后的数据直方图")

使用Box-Cox变换转换非正态数据

要在 caret 中使用 Box-Cox 变换,我们可以使用 BoxCoxTrans() 函数并将数据集传递给它。我们将对两种类型的数据执行 BoxCox 变换,即正偏态数据和负偏态数据。让我们看看相应的示例。

正偏态数据

正偏态数据意味着分布右侧的尾部更长。均值和中位数…

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